CleanPlex®UMI 技术是一种多重 PCR 或基于扩增子的 NGS 靶向测序技术，用于精确的肿瘤 DNA 分析。它具有高度先进的专有引物设计算法和创新的分子条形码化学。它们共同使得 CleanPlex UMI 即用型和定制 NGS 面板能够自信地检测游离 DNA (cfDNA) 中的低频变异（循环肿瘤 DNA - ctDNA）。
CleanPlex UMI 目标富集工作流程
CleanPlex UMI 基于多重 PCR 的目标富集工作流程。 CleanPlex UMI 技术允许轻松快速地准备分子条形码和目标富集的 NGS 文库用于测序。
超快速且简单的工作流程
CleanPlex UMI 技术具有简单的工作流程，可在 3.5 小时内完成，并且只需要 85 分钟的动手时间。可以快速制备分子条形码和目标富集的 NGS 文库，以便更快地获得结果。
CleanPlex UMI 技术具有的分子标识符
CleanPlex UMI 目标文库制备方案。CleanPlex UMI 协议涉及 3 个简单步骤，每个步骤包括热循环或孵育反应，然后使用磁珠进行文库纯化。简化的方案仅需 3.5 小时即可完成。完成该协议所需的仪器是热循环仪。
CleanPlex UMI 技术使用专有的多重 PCR 分子条形码化学来标记每个 DNA 分子。整合的分子标识符(UMI) 可以纠正测序数据中的 PCR 和测序错误，从而提高变异检测的灵敏度和特异性。
CleanPlex UMI（分子条形码）化学
CleanPlex UMI 分子条形码化学。CleanPlex UMI 工作流程的第一步是多重 PCR 反应，该反应使用 UMI 标记的目标特异性引物对感兴趣的目标进行条形码和扩增。第二步是生化反应，通过去除携带冗余和部分 UMI 的 PCR 产物来解析正确的 UMI。最后一步是使用 CleanPlex 双索引 PCR 引物的扩增反应，可确保高精度样品解复用，以扩增样品级索引并将其添加到 NGS 文库中。建议使用CleanMag®磁珠进行文库纯化。
CleanPlex UMI 技术结合了分子标识符 (UMI)，能够可靠地检测低频变异。可以根据测序数据构建共有序列，以在变体调用之前消除 PCR 和测序错误。因此，可以准确地将真正的突变与背景噪声区分开来。借助 CleanPlex UMI 技术，只需 30 ng 的输入 DNA，即可高特异性地检测低于 0.5% 等位基因频率的低频变异。
UMI 支持准确的变体调用。使用 CleanPlex UMI 肺癌面板，使用 50 ng 次要等位基因频率 (MAF) 为 0.1% 的 SeraCare Seraseq™ ctDNA Complete™ 突变混合物来制备靶向 NGS 文库，该文库涵盖了参考材料中存在的 13 个突变。使用和不使用 UMI 来分析所得数据。底部面板显示，启用 UMI 的纠错可显着减少误报，从而将真正的突变（橙色圆圈和三角形）与背景噪声（白色圆圈）区分开来。
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